3分钟上手scorpion-toxin-binder-design:datasets/pandas/hf download加载211个蛋白设计 【免费下载链接】scorpion-toxin-binder-design项目地址https://ai.gitcode.com/hf_mirrors/Anthropic/scorpion-toxin-binder-design点击查看免费下载scorpion-toxin-binder-design是 Anthropic 开源的蛋白质设计数据集Claude 从零设计de novo design出 211 个靶向 5 种蝎子毒素的蛋白结合剂binder其中 17 个经两家 CRO 实验室Adaptyv Bio 与 Twist Bioscience的 SPR 实验验证为有效 binder。3 分钟内你可以用datasets、pandas或hf download把核心表design.csv的 211 行蛋白设计数据加载到自己的分析环境。数据集里有什么这个仓库本质是一张设计 × 实验结果的总表外加全部原始数据文件内容行数design.csv全部 211 个设计序列、两个实验室的 hit/无 hit 结果与 KD、binder_against211in_silico_scores.csv结构预测评分ipSAE、scDockQ、pLDDT 等与 design.csv 同序211Cn2_competition_Twist_Bioscience.csv与抗体 LR、RU1、9004G 竞争结合 Cn2 的 BLI 实验20BVP_ELISA.csv多反应性polyreactivityELISA 筛查51controls.csv两个实验室的对照抗体记录115sensorgrams/每个设计一个文件夹传感图、原始迹线、动力学拟合按设计分目录supporting_tables/12 张辅助表设计来源、表达量、后续实验、逐种子评分—每一行的核心字段是uuid8 位设计编号如02090d8c被确认为 binder 的设计另有名字比如对 Cn2 的Cn2-B1uuid888c8f04。完整字段说明见 COLUMNS.md它解释了每个文件的每一列。方式一用 datasets 加载最推荐design.csv是默认子集只需一行from datasets import load_dataset designs load_dataset(Anthropic/scorpion-toxin-binder-design, splitfull) len(designs) # 211其他子集按文件名命名传名字即可例如设计来源表origin load_dataset(Anthropic/scorpion-toxin-binder-design, origin, splitfull)全部子集一览见 README.md 的 dataset 配置design、in_silico_scores、Cn2_competition_Twist_Bioscience、BVP_ELISA、toxins、controls、sensorgrams_index、structures_index以及supporting_tables/下的 12 张表如origin、expression、reverse_BLI等。方式二用 pandas 直读 hf:// 路径不想装 datasetspandas配合hf://URI 也能直接读远端 CSVimport pandas as pd table pd.read_csv( hf://datasets/Anthropic/scorpion-toxin-binder-design/design.csv, dtype{uuid: str}, # 关键uuid 按文本读 )⚠️新手最常踩的坑uuid是 8 位十六进制标识符如946282e8。不加dtype{uuid: str}电子表格或 pandas 会把它变成9.46E13这样的科学计数法浮点数。快速看看哪些设计成了 bindertable[[uuid, name, binder_against]].dropna(subset[name])方式三hf download 只下 CSV只想要数据表、不要几 GB 的原始迹线文件时可以精确筛选下载# 只下所有 CSV 表排除 sensorgrams 子文件夹 hf download Anthropic/scorpion-toxin-binder-design \ --repo-type dataset --include *.csv --exclude sensorgrams/*/* # 只下某一个设计的两个文件夹888c8f04 即 Cn2-B1 hf download Anthropic/scorpion-toxin-binder-design \ --repo-type dataset --include */888c8f04/*读懂结果列hit 和 binder 不是一回事design.csv中每个毒素有两组列如Cn2_Adaptyv_result/Cn2_Adaptyv_KD_nM和Cn2_Twist_result/Cn2_Twist_KD_nMhit/no hit该实验室是否检测到结合KD 单位是nM越小结合越紧空单元格表示未测或无拟合从不等于没有 hit见 COLUMNS.md 开头的约定binder_against填了哪个毒素说明该设计按 README.md 定义的 4 条标准两实验室均 hit、KD ≤ 1 µM、Rmax 合理、无 CLEC12A 背景信号被认定为该毒素的 binder。全库最终有 17 个 binderCn2 7 个、AaH II 4 个、AaH I 4 个、LqhIII 2 个。下一步深入原始数据加载好design.csv后按uuid去sensorgrams/uuid/找对应的_traces.csv逐时间点迹线、_kinetics.csv动力学拟合和传感图预测结构在structures/uuid/设计模型 ESMFold2/Protenix 预测复合物 PDB。想看 Claude 与 Cn2 的作用机制动画仓库assets/目录里还有一段 60 秒 4K 短片 assets/Scorpion_Cn2_film_60s_4K.mp4。引用时请使用Claude Science, et al. De novo design of protein binders against scorpion toxins with Claude.数据按 LICENSE.md 以 CC BY 4.0 发布可自由使用与再分发。小结load_dataset一行加载 211 个设计 →pd.read_csv(hf://…, dtype{uuid: str})快速取表 →hf download --include按需下载原始迹线。3 分钟你就能开始分析这套完整的AI 蛋白设计 湿实验验证数据了 赞分享【免费下载链接】scorpion-toxin-binder-design项目地址https://ai.gitcode.com/hf_mirrors/Anthropic/scorpion-toxin-binder-design点击查看免费下载相关推荐从头蛋白设计揭秘:10个设计集看 scorpion-toxin-binder-design 如何为蝎子毒素定制结合蛋白从头蛋白设计揭秘:10个设计集看 scorpion toxin binder design 如何为蝎子毒素定制结合蛋白 在 scorpion toxin bin抗毒蛋白设计的下一步:scorpion-toxin-binder-design数据的科研应用方向抗毒蛋白设计的下一步:scorpion toxin binder design数据的科研应用方向 scorpion toxin binder designspritejs 块级元素基类 Block 完全指南锚点、尺寸、边框与盒子模型详解spritejs 块级元素基类 Block 完全指南锚点、尺寸、边框与盒子模型详解 Block 是 spritejs 中所有块级元素的基类它继承自 Node创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考